以色列是恐怖活动的重灾区，打击恐怖活动任务非常繁重，传统的反恐怖力量不堪重负。为切实有效地打击恐怖活动，采取了赋予军队进行反恐怖任务的举措。并在法律上赋予军队反恐怖职能。实践证明，军队参与反恐是对反恐怖作战力量的极大加强，能够有效地震慑打击。在赋予军队都有反恐任务方面特别重要的是建立了专门的反恐怖作战部队。在这方面，以色列教训十分深刻。从1948年至1975年，以色列国内的各种反恐怖行动一直都由国防军一家独揽。国防军作为当时唯一的反恐怖力量，由于经费短缺以及对恐怖主义缺乏认识，从未进行过专门的反恐怖训练，其训练重点往往集中在远距离侦察巡逻、情报收集以及突击作战上，基本上不具备反恐怖作战能力。直到1974年的“玛阿洛特惨案”发生后，才引起国防军以及整个国家对恐怖主义的高度重视，从而也推动了以色列反恐行动队的建立与发展。
目前以军担任反恐任务的部队有数十支，如总参侦察营、雅马姆侦察队、海军第13突击队等等，其实以色列大部分特种部队都承担反恐任务。总的来说，以军反恐部队可分为三种类型，即反恐突击部队、反恐掩护部队和反恐支援部队。
1反恐突击部队。以色列特种部队专业反恐的主力，承担大多数人质营救任务。其中，雅马姆侦察队负责以色列国内反恐任务，总参侦察营负责国外反恐，海军第13突击队负责海上反恐，埃拉特侦察队负责以色列埃拉特市辖区的反恐任务。而在特殊场所，如以色列边境、港口、机场等，上述4支部队都可能执行反恐任务，具体取决于国防部和以色列国防军总参谋部的调遣。
2反恐掩护部队。负责反恐现场的安全警戒、搜集情报，第一时间赶赴现场，控制事态发展，等候反恐突击部队前来处理。只有在紧急情况下，譬如开始枪杀人质，反恐掩护部队才能发起攻击。目前在以色列的三个军区，即北方军区、中央军区和南方军区，分别部署有反恐掩护部队。北方军区部署有戈兰反恐掩护部队，中央军区部署有3支反恐掩护部队，南方军区部署有1支反恐掩护部队。由于反恐掩护部队和反恐突击部队在反恐任务中扮演不同的角色，因此人们通常把反恐掩护部队称为“外圈反恐部队”，而反恐突击部队称为“内圈反恐部队”。
3反恐支援部队。主要负责对反恐突击部队和反恐掩护部队进行反恐支援，编有军犬连、情报小组、计算机专家组、处理小组和电子干扰组。军犬连专门训练军犬对付。情报小组负责为反恐部队提供情报支援。计算机专家组负责为反恐部队制作反恐目标三维立体模型。电子干扰组负责监听事发现场的无线电通讯，必要时对通讯实施电子干扰。
除此之外，以色列在反恐领域还大量使用的高科技装备，如侦查、情报搜集、武器、特种车辆等的呢，这些装备在反恐行动中均发挥了重要的作用。为了培养反恐领域的专业人才，以色列还成立了专门的反恐学校，以色列国防军有一所反恐学校，即707部队。该学校被视为以色列国防军皇冠上的一颗明珠，也是外国政要来访必定要指名参观的一个经典景点。从它诞生之日起，就有无数慕名而来的外军特种部队队员到此取经学习。
以上种种措施，使得以色列成为了世界反恐领域的强者。
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