<div id="tet_c">赶到现场时，正赶上雷电将军即将收走托马的神之眼，旅行者抢过神之眼与将军大人对峙，却在下一瞬进入了一个与世隔绝的空间，出现在面前的是与现实中雷电将军一样模样的雷之神。
雷神一刀劈过，再回到现实世界时，旅行者已然晕倒。关键时刻，托马解开了双手束绳，带着旅行者仓皇逃出仪式，两人被全境通缉。
事到如今，社奉行也不安全，旅行者和派蒙前往边陲岛屿「海祇岛」寻找另一个反抗眼狩令的组织，不同于「三奉行」的珊瑚宫反抗军。珊瑚宫人们的祖先最早在地下城市「渊下宫」居住，信仰的神是魔神奥罗巴斯，后来奥罗巴斯带人们来到地上生活，他自己因为入侵稻妻的其它岛屿被雷神一刀斩杀，雷神没有追究民众的责任，人们在海祇岛上建了珊瑚宫，生活至今。现在，为了表达对眼狩令的抗议，他们再次举起反抗大旗。路上，旅行者正好救下了被围困的反抗军士兵哲平，跟着他来到反抗军大本营。之后在哲平带着旅行者了解营地时，稻妻幕府军队发起了进攻，哲平和旅行者一起前往前线。
战场上杀声震天，幕府军增援了正面战场，反抗军暂居下风，幸好反抗军首领珊瑚宫心海及时现身，带来了援军，北斗和万叶居然也以雇佣兵的身份参与其中。战机已失，幕府军暂时撤退。
这一战后，旅行者跟随心海前往珊瑚宫议事，并被授予海祇岛特别行动队队长职位，此外，心海提到有不愿意表露身份的资助方送来了大量物资。之后，旅行者和派蒙处理了一些任务，与此同时哲平的职位也在快速上升。
心海收到报告，反抗军中部分军士出现了诡异的老化症状，询问过后得知，原来他们使用了资助方给的“秘密武器”，旅行者认出这是愚人众的邪眼，使用力量会透支使用者的生命。旅行者和派蒙突然想起这段时间异常活跃的哲平，前往寻找哲平，果然他也使用了邪眼的力量，如今已经异常苍老。曾经热情洋溢的伙伴现在却白发苍苍，旅行者愤然找上心海收到的情报里的邪眼生产工厂，居然在工厂内发现了大量晶化骨髓，原来晶化骨髓里有奥罗巴斯的祟神怨念，勘定奉行找万国商会索要的晶化骨髓居然是给愚人众制造邪眼的！而工厂深处，出现在两人面前的是愚人众执行官第六席-散兵。眼狩令是愚人众暗中促成的，目的是借机推广邪眼，散兵表示人命如同草芥一般，旅行者怒火攻心，被祟神怨念影响，晕了过去。
等旅行者再睁开眼，出现在面前的是雷神的眷属-八重神子，神子说道稻妻的雷电将军其实只是雷神舍弃身体制作的人偶，只会不顾一切追求永恒，而真正的雷神叫影，为了追求永恒，保持自我，一直在「一心净土」中进行着无穷无尽冥想。肉身终会归于尘土，就由人偶之身来替代。精神亦难逃磨损，影便将意识寄宿于佩刀之中，用冥想来规避一切纷扰。
神子不认为永恒等于静止，影的永恒只是自己的永恒而已，她给了旅行者一个御守，希望旅行者进入一心净土后呼唤她，击败影，拯救眼狩令、拯救国家、拯救影。