顺庆府紧挨着清军占据的保宁，贺珍部又善战，放在第一线抵御清军正好。若其有反意，摆在第一线比摆在后方威胁小。为了怕贺珍不满，陈邦彦又升贺珍为南充总兵，将白蛟龙部三千人，拨与他指挥。
重庆府则交给降将李占春、于大海驻守，任二人为副将，分驻重庆、寿县、涪州。为防降将反复，陈邦彦令标营参将严思忠领兵一万，驻守重庆府忠州、澧都一带，依靠石砫马氏，扼住东川咽喉。
至于泸州府，在消灭了马应试后，已有四川总督樊一蘅的心腹爱将彭明扬领兵七千驻守。对彭明扬，陈邦彦是放心的，升其为泸州总兵，又再拨给他降兵三千，嘱其在泸州屯粮练兵。
陈邦彦又上奏朱亨嘉，在泸州、重庆、顺庆、夔州等地，各设知府、同知、推官、提学、知县、通判、典史等官吏。并严令各将，从今往后，军饷一律由朝廷供给，各将领只管军事，不得干预地方政事，更不得私征赋税，厚敛于民。违者重罚。
自从杀了泸州马应试，讨平了伪楚王朱容藩后，陈巡抚威名在外，诸将不敢不从。叙州、泸州、重庆、顺庆、夔州，藩镇割据的现象，荡然无存。
陈邦彦
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